Przyczyny konfliktów w organizacji leżą u podłoża kwestii wynikających z relacji społecznych. Podłoże społeczne to nadal szerokie pole badań i wielu obszarów nieodkrytych. To sprawia, iż nie sposób zidentyfikować i określić zbiór przyczyn konfliktów w organizacji.Dlatego, to co w literaturze przedmiotu jest przytaczane jako przyczyny konfliktów w organizacji, jest tylko próbą zidentyfikowania i zdefiniowania kilku najważniejszych i najistotniejszych przyczyn. Według J.A.F. Stonera i Ch. Wankela głównych przyczyn konfliktów w organizacji należy upatrywać w: podziale zasobów, odmienności przyjętych celów, współzależności pracy, odmienności poglądów, postaw, zachować i wartości, oraz w braku pełnego zrozumienia. Zaś według L. Ponda przyczyn konfliktu w organizacji upatruje w: podziale dóbr, sprawowaniu władzy i koordynacji działań organizacji. To tylko przykładowe, główne przyczyny konfliktów w organizacji. W rzeczywistości jest ich zapewne dużo więcej, ale jeszcze nie zostały odkryte.